法院可以按照以下方法对两个孩子进行判决：两个孩子一般一人一个。或是夫妻双方可以对子女抚养权的归属进行协商，一般是不满两周岁的子女，由母亲直接抚养为原则已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。
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如果双方都不要小孩，法院会依法判决由一方抚养或者轮流抚养等。
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如两方都主张孩子抚养权，法院会根据对孩子成长有利的原则判决孩子抚养权