协议的有效性取决于是否符合民法典的规定，即当事人具备民事行为能力、意思表示真实以及内容合法。若协议满足这些条件，即使私下签署，仍然可以起诉对方。但要注意，不处理违法协议可能会导致法律纠纷和不良后果。
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签订协议书后，如果发生争议并且无法通过协商达成解决方案，可以选择起诉对方。除了协商，还可以尝试调解作为另一种解决方式。最终，如果必要，可以通过诉讼来解决争议，由法院根据事实和法律作出判决。