实习期内两次闯红灯将罚款400元记12分，可能注销实习准驾资格。根据《机动车驾驶证申领和使用规定》，实习期闯红灯罚款200元记6分，记满12分将注销实习准驾资格，严重影响驾驶资格获取。
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实习期闯红灯常见处理为缴纳罚款并接受记分。选择处理方式时，应尽快缴纳罚款并关注记分情况，若记分接近或达到12分，需考虑可能的驾驶资格注销风险，并咨询交警部门。
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实习期两次闯红灯需缴罚款并记分。具体操作：1.收到罚款通知后，及时到指定银行或线上平台缴纳罚款；2.关注记分情况，若两次闯红灯导致记分达到或接近12分，需立即咨询交警部门了解后续处理流程；3.若记分未达12分，也需警惕，避免再次违章，否则可能面临实习准驾资格注销的风险。